1993年，公司创始人郑鹏用他以前贩面粉积攒下来的全部家当2.5万元买了一个土焦厂，开启了他的创业之路。经过8年的努力，把一个土焦炉发展到了30多个土焦炉，成为当地的炼焦大户。
2000年，受政策影响，土焦炉被强制取缔。鹏飞用一台不足50万元的洗煤设备开始洗煤。又过了8年，把1个小洗煤厂扩张到了22个洗煤厂，成为当时全国最大、拥有1500万吨洗煤能力的独立洗煤企业，成为宝钢、鞍钢、首钢等全国各大钢厂的合作伙伴。
2008年，受金融危机影响，煤价暴跌，公司洗煤业务受到极大影响。鹏飞开始向焦化行业发展，陆续收购了当地的一些焦化企业。2010年，响应政府“以煤为基，多元发展”的号召，决定“上大焦化、大上焦化”的战略，打造“以焦为辅，以化为主”的新型绿色焦化发展模式。2011年5月15日，上马了500万吨焦化项目，2013年5月19日，又配套上马了60万吨甲醇联产LNG合成氨项目。
2013年开始，煤价大跌，煤炭形势极度低迷，很多煤炭企业濒临倒闭，鹏飞利用这种绝佳的机遇开始后向一体化整合，整体收购了长治马军峪煤业公司，至2021年，公司拥有全资煤矿15座，参股煤矿27家，产量2300万吨，成为实力雄厚的煤、焦、化一体化企业。
随着500万吨焦化项目的陆续投产，鹏飞开始布局氢能源产业。2017年3月，超级悬浮床加氢项目开工奠基；2019年12月，与美国GCES公司百亿氢能源项目成功签约；2021年1月1日，鹏湾氢港氢能产业园项目正式开工建设，至此，鹏飞集团开始向全球终极绿色能源——氢能源产业全面进军。
